Ključna razlika med melatoninom in serotoninom je v tem, da je melatonin hormon, ki nam pomaga zaspati, medtem ko je serotonin nevrotransmiter, ki nam pomaga, da se počutimo budne, ko naslednji dan vstanemo.
Melatonin je nevrotransmiterju podobna snov. Je hormon, ki se v temi povečuje. Serotonin je nevrotransmiter, ki deluje nasprotno melatoninu. Raven serotonina se poveča na sončni svetlobi. Tako melatonin kot serotonin uravnavata različne funkcije v našem telesu, kot so apetit, razpoloženje in spanje. Na kratko je melatonin snov, ki nam pomaga, da gremo spat, medtem ko je serotonin snov, ki nam pomaga, da se naslednje jutro počutimo budne.