Ključna razlika med melaninom in melatoninom je v tem, da je melanin eden glavnih pigmentov, ki jih najdemo v človeški koži, laseh in očeh, medtem ko je melatonin hormon, ki ga proizvaja epifiza in ima vlogo pri zaspanosti in uravnavanju budnosti spanja cikel.
Melanin in melatonin sta dve kemijsko sorodni snovi, vendar z veliko različnimi značilnostmi. Njihov izvor, funkcija, kemična sestava in lokacija v človeškem telesu se zelo razlikujejo. Zato ta članek poskuša razpravljati o razliki med melaninom in melatoninom.