Ključna razlika med gametofitsko in sporofitsko samozdružljivostjo je v tem, da je v sistemu gametofitske samokompatibilnosti fenotip cvetnega prahu določen s svojim gametofitskim haploidnim genotipom, medtem ko je pri sporofitni samokompatibilnosti fenotip cvetnega prahu določen z diploidnim genotipom rastline.
Samozdružljivost je mehanizem za nadzor opraševanja v rastlinah. Predvsem preprečuje samoopraševanje in uveljavlja navzkrižno opraševanje, kar je evolucijsko koristno. Samozdružljivost se pojavi kot posledica negativnih kemičnih interakcij med cvetnim prahom in slogovnim tkivom znotraj istega alela. Čeprav so cvetni prah in plodnice sposobni za preživetje in so plodni, pri teh rastlinah kalitev cvetnega prahu ne poteka. Kadar se kalitev cvetnega prahu ne zgodi, se cvetni prah ne more oblikovati. Potem pelodi ne uspejo dostaviti moških spolnih celic v ženske spolne celice za oploditev. Posledično ne morejo proizvajati semen.
Obstajata dva glavna sistema samokompatibilnosti, kot sta gametofitna samokompatibilnost in sporofitna samokompatibilnost. So samokompatibilni sistemi z enim lokusom, ki temeljijo na enem samem večalelnem lokusu (S). Ta lokus je sestavljen iz ene peščice, ki izraža gen S in enega cvetnega prahu, ki izraža gen S.
