Ključna razlika med epistatičnim genom in hipostatičnim genom je v tem, da je epistatični gen gen, ki vpliva na izražanje drugega gena v drugem lokusu, medtem ko je hipostatični gen tisti, ki je podrejen vmešavanju epistatičnega gena.
Nekateri geni so za izražanje odvisni od drugih nealelnih genov. Epistaza je oblika genske interakcije, pri kateri en gen moti ali prikrije izražanje drugega gena, ki se nahaja v drugem lokusu. Zato gre za nekakšno nealelno interakcijo genov. Pri tej posebni interakciji genov sodelujeta dva gena, ki sta epistatični in hipostatični gen. V skladu s tem je gen, ki prikriva izražanje drugega gena, znan kot epistatični gen, medtem ko je gen, katerega izraženost vpliva, znan kot hipostatični gen.
