Ključna razlika med receptorji AMPA in NMDA je, da je specifični agonist receptorja AMPA alfa-amino - 3 - hidroksil - 5 - metil - 4 - izoksazol propionska kislina (AMPA), medtem ko je specifični agonist receptorja NMDA N - metil - D - aspartat (NMDA).
Obstajajo tri glavne vrste receptorjev za glutamat. Njihova razlika temelji na agonistu, ki se veže na aktivacijo receptorja za vezavo glutamata. Vezava glutamata bo odprla ionske kanale za transport natrijevih in kalijevih ionov. Tudi receptorji NMDA olajšajo pretok kalcijevih ionov skozi membrano.
