Ključna razlika med imunosupresijo in imunsko pomanjkljivostjo je v tem, da se imunosupresija nanaša na zmanjšanje učinkovitosti imunskega sistema, medtem ko se imunska pomanjkljivost nanaša na nezmožnost imunskega sistema za boj proti povzročiteljem bolezni.
Imunski sistem zazna širok spekter nalezljivih povzročiteljev, ki vstopajo v naše telo, in nas ščiti pred boleznimi. Zato je obrambni sistem v našem telesu. Vsebuje različne vrste imunskih celic. Imunski sistem deluje prek dveh podsistemov: prirojenega imunskega sistema in prilagodljivega imunskega sistema. Pri zdravem posamezniku imunski sistem deluje normalno in preprečuje pojav bolezni. Ko pa pride do motenj v imunskem sistemu, ta ne deluje aktivno. Imunska pomanjkljivost je takšno stanje, pri katerem sposobnost imunskega sistema za boj proti boleznim postane nizka ali odsotna; imunosupresija je drugo stanje, povezano z imunskim sistemom, pri katerem se učinkovitost imunskega sistema zmanjša.
