Ključna razlika med tardivno diskinezijo in distonijo je v tem, da je tardivna diskinezija vedno sekundarna pri dolgotrajni uporabi nevroleptikov, vendar je distonija lahko posledica različnih vzrokov. Poleg tega je distonija nenormalen mišični tonus, ki povzroči mišične krče ali nenormalne drže. Medtem ko se tardivna diskinezija nanaša na neobvladljive ustnice in ustnice, ki se razvijejo po dolgotrajni uporabi nevroleptikov.
Oba stanja sta nenormalni motnji gibanja; distonije vključujejo različne gibalne motnje, ki se pojavijo iz različnih razlogov, medtem ko je tardivna diskinezija le podskupina primarnih distonij.