Ključna razlika med fagocitozo in opsonizacijo je v tem, da je fagocitoza mehanizem, ki ga nekatere celice ali organizmi izvajajo za vnos ali zajemanje tujih delcev, medtem ko je opsonizacija postopek, s katerim se patogeni odstranijo iz sistema, ko so označeni s pomočjo opsoninov.
Imunološki odzivi so lahko prirojeni ali prilagodljivi. Patogeni imajo receptorje za prepoznavanje patogenov, ki jih gostitelj lažje prepozna. Opsonizacija in fagocitoza sta dva imunološka odziva. Pri opsonizaciji gostitelj identificira in označi napadljive delce za uničenje s proizvodnjo opsoninov. Fagocitoza je mehanizem, s katerim nekatere imunske celice zajemajo in uničujejo vdrle delce ali tujke iz telesa.
