Ključna razlika med fagocitozo in pinocitozo je v tem, da je fagocitoza oblika endocitoze, ki skozi plazemsko membrano prevzame trdne snovi v celico, medtem ko je pinocitoza druga oblika endocitoze, ki skozi plazemsko membrano v celico privzame tekočine, vključno z topljenimi sredstvi in majhnimi molekulami.
Endocitoza je mehanizem, s katerim celice v celico vnašajo makromolekule in druge suspendirane delce, vključno s celičnimi deli, makromolekularnimi agregati in tujki. Eksocitoza je nasprotni mehanizem endocitoze, s katerim celice izločajo snovi iz celic. Eksocitoza poteka predvsem v sekretornih celicah. Obstajata dve vrsti endocitoze, ki temeljita na naravi delcev, ki se vnesejo v žive celice. So fagocitoza in pinocitoza. Mehanizem, ki se uporablja v obeh procesih, je enak. Oblikujejo vezikule, ki obdajajo materiale, da jih odnesejo noter. Oba procesa sta aktivna procesa. Tako lahko mitohondrije opazujete v bližini površin, kjer se ti procesi pojavljajo.
