Ključna razlika med paraziti in bakterijami je, da so bakterije enocelični mikroskopski prokarionti, ki živijo povsod, medtem ko so paraziti organizmi, ki živijo na ali v svojih gostiteljih in hkrati povzročajo okužbe gostiteljem.
Paraziti in bakterije so organizmi, ki spominjajo na zelo primitivne organizme, vendar imajo velike prilagoditve za preživetje v različnih okoljskih pogojih. Za človeka so ti organizmi najpomembnejši, ker večino človeških okužb povzročajo ti. Včasih se nekatere bakterije štejejo za parazite.
