Ključna razlika med hidrofobnimi in hidrofilnimi aminokislinami je v tem, da so hidrofobne aminokisline nepolarne, medtem ko so hidrofilne aminokisline polarne.
Aminokisline so gradniki beljakovin. Beljakovina je velikanska polimerna molekula, ki je bistvena sestavina vseh živih organizmov. Poleg tega so aminokisline v glavnem v dveh vrstah kot esencialne in nebistvene aminokisline. Poleg tega jih lahko kategoriziramo kot hidrofilne in hidrofobne aminokisline, odvisno od njihove fizikalno-kemijske narave. Med seboj se razlikujejo predvsem glede na polarnost.
