Ključna razlika med fotobiontom in mikobiontom je v tem, da se fotobiont nanaša na fotosintetsko komponento lišaja, to je zelena alga ali cianobakterija, medtem ko se mikobiont nanaša na glivično komponento lišaja, ki je večinoma askomicete ali bazidiomicete.
Med živimi organizmi obstajajo različne vrste simbiotičnih odnosov. Simbiotsko razmerje je združenje, v katerem dve različni vrsti organizmov živita skupaj. Poleg tega so parazitizem, vzajemnost in komenzalizem tri vrste simbiotskih odnosov. Vzajemnost je koristna za obe strani. Lišaj je takšna vrsta vzajemne zveze, ki obstaja med algami / cianobakterijami in glivami. V tem združenju je ena stranka odgovorna za proizvodnjo hrane s fotosintezo, druga pa za absorpcijo vode in zagotavljanje zavetja. Na podlagi tega je alga / cianobakterija znana kot fotobiont, ki izvaja fotosintezo, medtem ko je gliva znana kot mikobiont, ki zagotavlja zavetje in absorbira vodo.