Ključna razlika med antigenom in protitelesom je v tem, da je antigen katera koli snov, ki imunski sistem spodbudi k tvorbi protiteles proti njemu, medtem ko je protitelo zaščitni protein imunoglobulina v obliki črke Y, ki se lahko veže z antigeni, da jih nevtralizira.
Jedro razumevanja imunologije, pa tudi nekaterih vidikov mikrobiologije, patologije in dermatologije, temelji na razumevanju osnovnih konceptov reakcij antigen-protitelesa. To so gradniki ogromnih podlag za znanje in novo razvijajoče se tehnologije za boj proti različnim količinam bolezni.