Ključna razlika med nevrotransmiterji in hormoni je, da so nevrotransmiterji kemični sesalci, ki jih živčni sistem uporablja za prenos živčnega impulza po sinapsah, medtem ko so hormoni kemični sel, ki jih endokrini sistem uporablja za stimulacijo ali komunikacijo s specifičnimi ciljnimi celicami.
Živčni sistem in endokrini sistem sta zelo pomembna organska sistema v našem telesu, ki uravnavata različne dejavnosti. Oba sistema sta odvisna od sproščanja posebnih kemikalij bodisi kot nevrotransmiterji bodisi kot hormoni. Ti nevrotransmiterji in hormoni delujejo kot kemični prenašalci in olajšajo prenos živčnega impulza in uravnavanje fizioloških aktivnosti v našem telesu.