Ključna razlika med auksinom in citokininom je, da auksin spodbuja razvejanje korenin, medtem ko citokinin zavira razvejanje korenin in stransko tvorjenje korenin. Če k temu dodamo še več, je auksin v glavnem odgovoren za raztezanje celic v stebelnih in koreninskih konicah, medtem ko so citokinini v glavnem odgovorni za delitev celic, zato jih najdemo v rastnih območjih.
Fitohormoni, znani tudi kot rastlinski hormoni, so pomembne kemične snovi za rast in razvoj rastlin. So organske molekule in delujejo kot signalne molekule, ki uravnavajo razvoj rastlin. Obstaja pet glavnih vrst rastlinskih hormonov: auksin, giberelin, citokinin, etilen in abscisna kislina. Tako opravljajo različne funkcije sami in skupaj vplivajo na rast rastlin.