Ključna razlika med klasično in moderno genetiko je v tem, da je klasična genetika mendelovska genetika ali starejši koncept genetike, ki je izražen izključno na podlagi fenotipov, ki so bili rezultat vzrejnih poskusov, moderna genetika pa je nov koncept genetike, ki omogoča neposredno preiskovanje genotipov skupaj s fenotipi.
Veliki znanstvenik Gregor Mendel je oče genetike. Mendel je uvedel več zakonov o dedovanju lastnosti in o tem, kako lastnosti prehajajo od staršev do potomcev. Tako so njegove ugotovitve postale osnova povsem novega koncepta, odkritega kasneje v genetiki. Klasična genetika in moderna genetika sta torej dva različna koncepta. Vendar je klasična genetika osnova sodobne genetike.