Encim vs beljakovine
Beljakovine in encimi so biološke makromolekule, sestavljene iz številnih aminokislin, povezanih skupaj kot linearne verige. Aminokislina je osnovna strukturna in funkcionalna enota teh makromolekul. Aminokislinska molekula je sestavljena iz štirih osnovnih skupin; in sicer amino skupina, stranska veriga (R-skupina), karboksilna skupina in atom vodika, ki so vezani na osrednji atom ogljika. V bistvu obstaja dvajset aminokislin, ki se pojavljajo v naravi in se razlikujejo le po stranski verigi (R-skupina). Vrstni red aminokislin določa strukturo in funkcije beljakovin in encimov.
Encimi
Encimi so posebni tridimenzionalni kroglasti proteini, ki lahko delujejo kot biološke molekule, katalizirajo in uravnavajo kemične reakcije v organizmih. V eni sami celici je na tisoče različnih encimov. To je zato, ker skoraj vsaka reakcija v celici zahteva svoj specifični encim. Običajno encimi povzročajo, da se celične reakcije pojavijo milijonkrat hitreje kot ustrezne nekatalizirane reakcije. Aktivna mesta, prisotna na površini encima, določajo njihovo stopnjo specifičnosti. Vrste encimske specifičnosti vključujejo absolutno specifičnost, stereokemijsko specifičnost, specifičnost skupine in specifičnost povezave. Aktivna mesta so razpoke ali votline na površini encima, ki nastanejo zaradi nastanka terciarne strukture. Nekatera aktivna mesta vežejo samo eno določeno spojino, druga pa skupino tesno povezanih spojin. Reakcija, ki jo katalizirajo, ne vpliva na encime. Na aktivnost encima vplivajo štirje dejavniki, in sicer; temperatura, pH, koncentracija substrata in koncentracija encimov.
Beljakovine
Beljakovine so najrazličnejše biološke makromolekule, tako funkcionalno kot strukturno. So polimeri aminokislin. Zaporedje aminokislin določa njihovo osnovno strukturo in delovanje. Osnovne funkcije proteinov so encimska kataliza, obramba, transport, podpora, gibanje, regulacija in shranjevanje. Strukturo beljakovin lahko izrazimo s hierarhijo štirih ravni; primarni, sekundarni, terciarni in kvaternarni. Zaporedje aminokislin je primarna struktura beljakovin. Tvorjenje sekundarne strukture je posledica rednega medsebojnega delovanja skupin v peptidni hrbtenici s tvorbo vodikovih vezi. Tako nastaneta dve različni vrsti struktur, in sicer; beta (β) - nagubani listi in alfa (α) - vijaki ali tuljave. Pregib in povezave beljakovinske molekule končno naredijo njeno 3D obliko, imenovano terciarna struktura. Beljakovine z več polipeptidi povzročajo kvaternarno strukturo.
Kakšna je razlika med encimom in beljakovinami?
• Vsi encimi so kroglaste beljakovine, vendar niso vsi beljakovine globularni. Nekateri proteini so kroglasti, drugi pa ne (Vlaknasti deli imajo dolge tanke strukture).
• Za razliko od drugih beljakovin lahko encimi delujejo kot katalizatorji za katalizacijo in uravnavanje bioloških reakcij.
• Encimi so funkcionalne beljakovine, medtem ko so beljakovine lahko funkcionalne ali strukturne.
• V nasprotju z drugimi beljakovinami so encimi zelo substratno specifične molekule.
• Beljakovine lahko encimi (proteaze) prebavijo ali razgradijo.