Ključna razlika med navzkrižno okužbo in sekundarno okužbo je v tem, da se navzkrižna okužba nanaša na prenos škodljivih mikroorganizmov z druge osebe, medicinske opreme ali orodij, medtem ko je sekundarna okužba okužba, ki se pojavi med ali po zdravljenju zaradi druge okužbe.
Okužbe je mogoče preprečiti z vzdrževanjem čistih in temeljito saniranih prostorov okoli bolnikov. Zato si zdravniki pogosto umivajo roke. Poleg tega se v bolnišnicah vzdržuje sterilno okolje. Navzkrižna in sekundarna okužba sta dve vrsti okužb, pred katerimi je treba rešiti bolnike.