Ključna razlika med preprostimi beljakovinami in konjugiranimi beljakovinami je v tem, da so enostavne beljakovine sestavljene iz aminokislin, ki so med seboj povezane in tvorijo veliko molekulo, medtem ko so konjugirane beljakovine kompleksne molekule, ki vsebujejo enostavne beljakovine in nebeljakovinske sestavine.
Beljakovina je molekula biopolimera. To pomeni; beljakovinska molekula vsebuje številne ponavljajoče se enote, vezane na kovalentne vezi. Te ponavljajoče se enote predstavljajo aminokisline, ki so bile uporabljene pri tvorbi beljakovin. Glede na kemično sestavo beljakovin obstajata dve vrsti beljakovin kot preprosti proteini in konjugirani proteini.