Ključna razlika med pteridofiti in fanerogami je v tem, da so pteridofiti žilne rastline brez semen in brez cvetov, medtem ko so fanerogame žilne rastline, ki semejo in cvetijo.
Kingdom Plantae ima dva podkraljevstva, kot sta kriptogama in Phanerogamae. Cryptogamae vključuje rastline, ki se razmnožujejo skozi spore. Tako so te rastline rastline brez semen in brez cvetov. Poleg tega ima pod kraljestvo tri glavne skupine, kot so Thallophyta, Bryophyta in Pteridophyta, ki vključuje mahove, alge, lišaje in praproti. Po drugi strani podkraljestvo Phanerogamae vključuje semenske rastline golonožnice in kritosemenke. Proizvajajo vidne reproduktivne strukture, imenovane cvetovi. Tako pteridofiti kot fanerogami so žilne rastline. Glavni cilj tega članka je razpravljati o razliki med pteridofiti in fanerogami.