Ključna razlika med acidofilnimi in bazofilnimi je v tem, da so acidofilne komponente celice ljubeče do kisline, kisla barvila pa se uporabljajo za njihovo obarvanje, medtem ko bazofilne sestavine celice ljubijo bazo, osnovna barvila pa se uporabljajo za njihovo obarvanje.
Obarvanje je tehnika, ki se uporablja za vizualizacijo celic in njihovih sestavnih delov, saj je veliko celic brezbarvnih in prozornih. Nekateri sestavni deli celice so kisloljubni, nekateri deli pa nežne. Kisla barvila in osnovna barvila sta dve vrsti barvil, ki se pogosto uporabljata pri navedbi postopkov. Bazofilno barvanje uporablja osnovna barvila, medtem ko acidofilno barvanje uporablja kisla barvila. Zato se acidofilne ali kisloljubne komponente vežejo s kislimi barvili, medtem ko se bazofilne ali bazno nežne komponente vežejo z osnovnimi barvili.
