Ključna razlika med UPGMA in drevesom, ki se pridruži sosedu, je vrsta filogenetskega drevesa, ki izhaja iz posamezne metode. UPGMA je tehnika gradnje koreninskega filogenetskega drevesa, medtem ko je drevo, ki se pridruži sosedu, tehnika gradnje nekoreniranega filogenetskega drevesa.
Filogenetska drevesa so drevesni diagrami, ki prikazujejo evolucijske odnose med organizmi. Filogenetsko drevo ima lahko različne topologije, odvisno od tehnike, ki se uporablja za gradnjo dreves. UPGMA in sosednje drevo sta dve glavni metodi za izdelavo filogenetskih dreves.