Ključna razlika - Rooted vs Unrooted Philogenetic Tree
Filogenija je pomembno področje, ki raziskuje življenje na zemlji skozi čas. Razkriva povezavo med organizmi z njihovimi predniki in potomci. Odnosi med organizmi so shematično predstavljeni z različnimi drevesnimi upodobitvami, kot so dendogram, kladogram, fenogram, filogram itd. Filogenetsko drevo je razvejan drevesni diagram, ki razlaga filogenetska razmerja med organizmi s količino evolucijske razdalje. Obstajata dve glavni vrsti filogenetskih dreves, znani kot ukoreninjeni in nepokoreninjeni. Ključna razlika med ukoreninjenim in nepokoreninjenim filogenetskim drevesom je v tem, da ukoreninjeno drevo kaže najbolj baznega prednika drevesa, medtem ko nepokoreninjeno filogenetsko drevo ne kaže korena prednika.
VSEBINA
1. Pregled in ključna razlika
2. Kaj je ukoreninjeno filogenetsko drevo
3. Kaj je ukoreninjeno filogenetsko drevo
4. Vzporedna primerjava - ukoreninjeno v primerjavi z nepokoreninjenim filogenetskim drevesom
5. Povzetek
Kaj je ukoreninjeno filogenetsko drevo?
Koreninsko filogenetsko drevo je koristen diagram, ki prikazuje evolucijsko zgodovino. Ima bazalno vozlišče, ki se imenuje koren in predstavlja skupnega prednika vseh skupin drevesa. Koren drevesa velja za najstarejšo točko drevesa, ki predstavlja zadnjega skupnega prednika vseh skupin, vključenih v drevo. Ukoreninjeno drevo torej kaže smer evolucijskega časa. Iz ene same vrste ukoreninjenega drevesa je mogoče najti skupnega prednika ali prednika vrste s sledenjem nazaj do bazalnega vozla. Ker ukoreninjeno drevo prikazuje smer evolucijskega časa, je enostavno najti starejše ali novejše skupine, ki jih ima. Koreninsko drevo lahko uporabimo za preučevanje celotnih skupin organizmov. Natančno ukoreninjenje filogenetskega drevesa je pomemben in ključen dejavnik, saj lahko nenatančno ukoreninjenje povzroči napačne interpretacije genskih sprememb med organizmi in njihovo smer razvoja.
Slika 01: Koreninsko filogenetsko drevo
Kaj je nekorijenjeno filogenetsko drevo?
Nekoreninjeno filogenetsko drevo je filogenetski diagram, ki nima skupnega prednika ali bazalnega vozlišča. Ta vrsta drevesa ne kaže izvora evolucije interesnih skupin. Prikazuje le razmerje med organizmi, ne glede na smer evolucijske časovne linije. Zato je težko proučevati evolucijske odnose skupin glede na čas s pomočjo nepokoreninjenega drevesa.
Obstajata dva glavna načina ukoreninjenja nepokoreninjenega filogenetskega drevesa. So
Iskanje skupine - Za to je potrebno predhodno znanje o odnosih med taksoni. Potem lahko takson, ki leži zunaj skupine, uporabimo kot zunanjo skupino za risanje ukoreninjenega filogenetskega drevesa
Iskanje srednje točke ali razdalje - Za srednjo razdaljo dveh taksonov v drevesu lahko domnevamo, da je koren filogenetskega drevesa
Slika 02: Nekoreninjeno filogenetsko drevo
Kakšna je razlika med ukoreninjenim in nepokoreninjenim filogenetskim drevesom?
Diff Article Sredina pred mizo
Ukoreninjeno vs Nekoreninjeno filogenetsko drevo |
|
Ukoreninjeno filogenetsko drevo je diagram, ki prikazuje zadnjega skupnega prednika skupin. | Nekoreninjeno filogenetsko drevo prikazuje razmerja med organizmi, ne da bi pokazalo skupnega prednika. |
Vozlišče | |
Ima vozlišče (koren). | Nima vozlišča. |
Smer evolucije | |
Ima smer, ki označuje evolucijski čas. | Ne določa evolucijskega odnosa. |
Odnos do drugih | |
Drevo omogoča določitev razmerja med predniki in potomci med skupinami. | Drevo ne dovoljuje govora o odnosu prednik - potomec. |
Povzetek - Rooted vs Unrooted Filogenetic Tree
Filogenetsko drevo predstavlja evolucijske poti in povezave med organizmi z uporabo razvejanih drevesnih diagramov. Filogenetski tres je lahko ukoreninjen ali izkoreninjen. Koreninsko drevo ima v osnovi vozlišče, ki predstavlja skupnega prednika, ki povezuje vse interesne skupine. Nekoreninjeno drevo prikazuje razmerja med organizmi. Vendar pa ne prikazuje skupnega prednika, ki ga imajo vse skupine. To je razlika med ukoreninjenim in nepokoreninjenim filogenetskim drevesom.