Ključna razlika med mikoplazmo in klamidijo je, da je mikoplazma rod bakterij, ki nima celične stene, medtem ko je klamidija rod bakterij, ki vključuje gram negativne in obvezne parazite.
Vrste mikoplazme so najmanjše bakterije, ki so jih še odkrili, z najmanjšimi genomi in minimalnim številom zelo nujnih organelov. Mikoplazma je bakterija brez sten. Zato nimajo določene oblike. Na splošno so sferične do nitastih celic. V nasprotju s tem je klamidija rod bakterij, ki ima celične stene. So gram negativne bakterije. Tako mikoplazma kot klamidija povzročata spolno prenosljive bolezni. Poleg tega povzročajo podobne simptome, vendar jih je mogoče zdraviti z različnimi antibiotiki.
