Ključna razlika med alelopatijo in antibiotiko temelji na vrsti učinka, ki ga povzroči posamezen pojav. Alelopatija povzroča tako pozitivne kot negativne učinke na odnos med dvema ali več organizmi, medtem ko antibioza negativno vpliva na enega od organizmov, ki sodelujejo v razmerju.
Prehrana ima pomembno vlogo pri preživetju organizmov. V tem okviru je razmerje med organizmi glede potrebe po hranilih ključnega pomena. Tako alelopatija kot antibiotika sta razmerja med dvema ali več organizmi. Vendar se med seboj odzivajo v različnih oblikah.
