Ključna razlika med materinim in očetovim testiranjem DNK je odvisna od vrste vira DNA, uporabljenega v postopku testiranja. Testiranje materine DNA uporablja mitohondrijsko DNK za pridobitev materinskega porekla, medtem ko testiranje očetovske DNK uporablja Y-DNA za pridobitev očetovskega porekla.
Določitev prednikov pri moških in ženskah je pomembna za določitev družinskih odnosov. Poleg tega testi DNK mater in očetov določajo tudi identiteto posameznikov. Nekatere molekularne tehnike, ki se uporabljajo v tej analizi, so odvzem prstnih odtisov DNA, analiza kratkih tandemskih ponovitev in polimorfizem dolžine restrikcijskega fragmenta (RFLP).
