Ključna razlika med mikrospornim in cvetnim prahom je, da je mikrospora majhna spora, ki se v rastlinah razvije v moški gametofit, medtem ko je cvetni prah majhno zrno, ki vsebuje moški gametofit.
Razmnoževanje rastlin poteka tako spolno kot nespolno, kar kaže na izmenjavo generacij. Obstajata dve generaciji, znani kot sporofitna generacija in gametofitska generacija. Zrno mikrospore in cvetnega prahu sta dve strukturi, ki se razvijeta v teh dveh generacijah. Microspore je struktura sporofitne generacije, medtem ko je zrno cvetnega prahu struktura gametofitske generacije. Tudi mikroskop ni gametofit, medtem ko je cvetni prah gametofit.
