Ključna razlika med troponinom I in troponinom T je v tem, da se troponin I veže z aktinom, medtem ko se troponin T med krčenjem mišic veže s tropomiozinom.
Troponini so pomembne beljakovinske molekule, ki sodelujejo pri krčenju mišic. Študije o troponinu se močno povečujejo zaradi njegovega glavnega pomena kot srčnega označevalca pri ishemičnih srčnih boleznih. V človeški fiziologiji obstajajo tri vrste troponinov. Trije ločeni geni kodirajo te tri vrste troponinov; Troponin C, Troponin T in Troponin I. Troponin I in Troponin T se v napovedih uporabljajo kot srčni označevalci. Tako se Troponin I med krčenjem mišic veže na aktinske filamente, da zadrži kompleks aktin-tropomiozin na mestu. Po drugi strani pa se troponin T veže na tropomiozin med mišičnimi kontrakcijami. Troponin T pomaga tropomiozinu, da počiva na aktinu. Zato je ključna razlika med Troponinom I in Troponinom T substrat, na katerega se vežejo med krčenjem mišic.