Ključna razlika med prostaglandinom E1 in E2 je v tem, da je prostaglandin E1 (PGE1) protivnetni dejavnik, medtem ko je prostaglandin E2 (PGE2) protivnetni dejavnik.
Prostaglandini so spojine, pridobljene iz lipidov, ki imajo hormonsko podobno funkcijo. Delujejo lahko kot avtokrine ali parakrine spojine, ki v živih organizmih povzročajo antagonistične ali sinergijske učinke. Prostaglandin E1 in prostaglandin E2 sta dve vrsti in se razlikujeta glede funkcionalnosti vnetja. Tako prostaglandin E1 kot E2 pripadata isti družini prostaglandinov E2, njihova osnova reakcije in njihovi učinki pa še niso popolnoma pojasnjeni. Uporabljajo se pri zdravljenju različnih biokemijskih mehanizmov pri živih bitjih.