Ključna razlika med hibridi DNA-RNA in dsDNA je, da so hibridi DNA-RNA dvoverižni nukleotidi, sestavljeni iz ene verige DNA in ene komplementarne verige RNA, medtem ko je dsDNA dvoverižna DNA, sestavljena iz dveh komplementarnih DNA verig.
V svojem izvornem stanju je DNA dvoverižna. Ima dve komplementarni verigi DNA, vezani preko vodikovih vezi. RNA je v svoji naravni strukturi enoverižna. V nekaterih primerih RNA tvori duplekse z DNA. Znani so kot hibridi DNA-RNA. V glavnem nastanejo med prepisovanjem in razmnoževanjem onkogenih virusov RNA. Hibridi DNA-RNA so v primerjavi z dsDNA stabilnejši.
