Ključna razlika med snRNA in snRNP je v tem, da so snRNA majhne molekule jedrske RNA, medtem ko so snRNP ali majhni jedrski ribonukleoproteini majhne molekule jedrske RNA s proteini.
snRNA so nekodirajoče, biološko aktivne majhne molekule RNA s povprečno velikostjo 150 nukleotidov. Običajno so prisotni v povezavi z beljakovinami kot snRNP v naravnem stanju. Zato so snRNP majhne jedrske RNA z več snRNP specifičnimi proteini. snRNP sodelujejo pri posredovanju ali uravnavanju dogodkov po translacijski obdelavi RNA, kot je spajanje itd. Tako snRNA kot snRNP najdemo v jedru evkariontskih celic.
