Ključna razlika med cilijami stereocilije in mikrovili je, da so trepalnice drobne lase podobne strukture, sestavljene iz mikrotubulov, medtem ko so stereocilije snopi las podobnih štrlin, sestavljeni iz aktinskih filamentov, mikrovili pa so gube celičnih membran, sestavljene iz aktinskih filamentov.
Cilia, stereocilia in microvilli se lahko pojavijo kot podobne strukture, če jih opazujemo od zunaj. A se med seboj strukturno in funkcionalno razlikujejo. So lase podobne strukture, ki so mikroskopske. Poleg tega so beljakovinska vlakna, ki segajo navzven od celic.
