Ključna razlika med kvantno biologijo in kemijo je v tem, da je kvantna biologija nova disciplina v znanosti, ki vključuje uporabo kvantne mehanike in teoretične kemije na vidike biologije, kemija pa znanost, ki preučuje sestavo, strukturo in lastnosti snovi.
Kvantna biologija in kemija sta dve veji znanosti. Kvantna biologija je uporaba kvantne mehanike v bioloških procesih. Kemija se ukvarja z lastnostmi, sestavo in strukturo snovi ter njihovimi pretvorbami. Zato kemija preučuje snov, medtem ko se kvantna biologija osredotoča na biološke procese, ki so kvantno mehanske narave.