Ključna razlika med primerjem in promotorjem je, da je primer komercialno sintetizirano kratko zaporedje DNA, ki se uporablja v PCR za amplifikacijo ciljnega zaporedja DNA, medtem ko je promotor specifično zaporedje DNA, ki zagotavlja varno začetno vezno mesto za RNA polimerazo in transkripcijske faktorje v da začne prepis.
Primer in promotor sta dve vrsti zaporedij DNA. Primer je majhen fragment DNA, potreben za verižno reakcijo s polimerazo (PCR). Ima kratka nukleotidna zaporedja, ki dopolnjujejo bočni konec verige DNA. Obstajata dve vrsti primerjev in delujeta kot izhodiščni točki za sintezo novih verig DNA. Nasprotno pa je promotor specifično zaporedje DNA, ki se nahaja gorvodno od mesta iniciacije transkripcije gena. Neposredno sodeluje s komponentami transkripcijskega mehanizma, kot so RNA polimeraza in transkripcijski faktorji, da bi nadziral transkripcijo DNA. Zato se RNA polimeraza in drugi transkripcijski faktorji vežejo na promotorsko zaporedje in sprožijo transkripcijo.
