Ključna razlika med mutagenom in teratogenom je v tem, da je mutagen snov ali sredstvo, ki povzroči spremembo zaporedja DNK posameznika, medtem ko je teratogen sredstvo, ki med nosečnostjo škoduje plodu ali zarodku v razvoju.
Mutageni in teratogeni so običajno kemični dejavniki. Fizična in biološka sredstva pa lahko delujejo tudi kot mutagen ali teratogen. Oboje lahko pri posameznikih povzroči zelo škodljive ali smrtne učinke. Izboljšanje biotehnologije pa je omogočilo nov vpogled v koncepte mutagenih in teratogenov.
