Ključna razlika med kodominanco in več aleli je v tem, da kodominanca izraža učinke obeh alelov neodvisno, brez mešanja v heterozigotnem stanju, medtem ko se več alelov nanaša na stanje lastnosti, ki ima več kot dva različna alela.
Na splošno ima vsak gen dva različna alela. Eden je dominantni alel, drugi pa recesivni alel. Glede na Mendelovo dedovanje dominantni alel izraža svoj fenotip, hkrati pa zavira recesivni alel v heterozigotnem stanju. Vendar pa imajo nekateri geni tri ali več različnih alelov za eno lastnost. Imenujejo se več alelov. Poleg tega je kodominanca nemeldelska dediščina. Pri tem pojavu potomci prejmejo oba roditeljska gena kot kombinacijo obeh genov. Zato sta oba gena pri potomcih izražena enako.