Ključna razlika med regulativnim in repretorskim beljakovinami je v tem, da regulativni protein lahko spodbuja ali zavira prepisovanje genov. Medtem represorski protein zavira izražanje enega ali več genov.
Preden se poglobimo v razpravo o razliki med regulatornim in repretorskim proteinom, na kratko razpravljajmo o genski regulaciji. Gen je specifično nukleotidno zaporedje, v katerem so genetske informacije skrite za sintezo beljakovin. Ekspresijo genov lahko reguliramo na različne načine. Z različnimi mehanizmi celice nadzorujejo izražanje genov in njihovo stopnjo izražanja. Na splošno se regulacija genov pojavlja na ravni transkripcije. Regulativni protein in represorski protein sta dve vrsti beljakovin, ki sodelujeta pri regulaciji genov na ravni transkripcije. Ti regulativni proteini in represorski proteini se vežejo na določeno zaporedje v bližini gena in vplivajo na transkripcijo gena.
