Ključna razlika med kemoorganotrofi in kemolitotrofi je v tem, da so kemoorganotrofi organizmi, ki pridobivajo elektrone iz organskih spojin, medtem ko so kemolitotrofi organizmi, ki pridobivajo elektrone iz anorganskih spojin.
Živi organizmi se lahko razvrstijo v več kategorij glede na način prehranjevanja glede na vir energije in ogljika. Viri energije so sončna svetloba in organske spojine. Podobno obstajata dve vrsti virov ogljika, kot sta anorganski in organski. Štiri glavne kategorije so fotoavtotrofi, fotoheterotrofi, kemoautotrofi in kemoheterotrofi. Poleg tega na podlagi primarnega vira reducirnega ekvivalenta obstajata dve kategoriji, kot so organotrofi in litotrofi. Kemoorganotrofi in kemolitohotrofi sta dve skupini, ki uporabljata energijo za razbijanje kemičnih spojin. Vendar se med seboj razlikujejo glede na darovalca elektronov. Vir darovalca elektronov so organske spojine v kemoorganotrofih, medtem ko je vir redukcijskega ekvivalenta anorganski v kemolithotrofih.