Ključna razlika med homolognimi in homeolognimi kromosomi je v tem, da so homologni kromosomi kromosomi s skupnimi predniki, medtem ko so homeološki kromosomi kromosomi, ki imajo dvoumno naravo in so delno homologni.
Kromosomi so strukturne komponente, ki nosijo genetske informacije o organizmu. Jedrski material v evkariontih je razporejen tako, da tvori kromosome, ki so kompaktne strukture nukleinskih kislin in beljakovin. Poleg tega obstajajo različne vrste kromosomov, ki temeljijo na načinu delitve celic. Homologni in homeologni kromosomi sta dve vrsti kromosomov, ki igrata pomembno vlogo na področju genetike.