Ključna razlika med homolognimi strukturami in vestigialnimi strukturami je v tem, da so homologne strukture anatomsko podobne strukture, ki jih najdemo v različnih organizmih, ki imajo skupnega prednika, medtem ko so vestigialne strukture anatomske strukture, ki so izgubile svojo uporabnost za organizem.
Homologne strukture so vestigialne strukture sta dve vrsti anatomskih struktur, ki sta evolucijsko pomembni. Homologne strukture so podobne strukture, prisotne v različnih organizmih, ki prihajajo od skupnega prednika. V nasprotju s tem so vestigialne strukture strukture, ki niso več uporabne za organizme in imajo manjšo velikost.