Ključna razlika med alfa in beta vijačnico je odvisna od vrste vodikove vezi, ki jo tvorijo pri razvoju teh struktur. Alfa vijačnice tvorijo znotraj-molekularne vodikove vezi, medtem ko beta spiralne tvorijo med-molekularne vodikove vezi.
Kompleksni proteini imajo štiri strukturno organizacijske ravni - primarno, sekundarno, terciarno in kvaternarno. Sekundarne strukture proteinov tvorijo peptidne verige v različnih usmeritvah. Peptidne verige sestavljajo aminokislinska zaporedja, vezana na peptidne vezi. Zato v beljakovinah obstajata dve glavni sekundarni strukturi, kot alfa in beta spirala. Poleg tega obstajajo še druge sekundarne strukture, ki se imenujejo beta stružnica in strukture las. Ta članek se osredotoča predvsem na razliko med alfa in beta vijačnico.
