Ključna razlika med alfa in beta anomeri je v tem, da je v alfa anomeru hidroksilna skupina na anomernem ogljiku cis eksocikličnega kisika v anomernem središču, medtem ko je v beta anomeru hidroksilna skupina trans v eksociklični kisik.
Anomer je geometrijska razlika med ogljikovimi hidrati. To je vrsta epimera, v katerem lahko vidimo anomerni atom ogljika. Iz karbonilnega ogljika odprte verižne strukture ogljikovih hidratov izhaja anomerni atom ogljika. Zato nastanek ciklične strukture iz odprte verižne strukture imenujemo anomerizacija.
