Ključna razlika med heterokromatinom in evhromatinom je v tem, da je heterokromatin zelo zapakirana oblika kromatina, ki je na splošno neaktiven, medtem ko je evhromatin ohlapna oblika kromatina, ki je na splošno aktivna.
Kromatin je struktura, ki vsebuje verigo DNA kromosoma. Heterokromatin in evhromatin sta dve glavni vrsti kromatina, ki sta prisotni v celicah. Med strukturo in funkcijo heterokromatina in evhromatina obstaja razlika. Poleg tega se razlikujejo tudi od lastnosti transkripcije in replikacije.
