Ključna razlika med ektomikorizo in endomikorizo je v tem, da glivične hife ne prodrejo v kortikalne celice rastlinskih korenin pri ektomikorizah, medtem ko glivične hife prodrejo v kortikalne celice rastlinskih korenin v endomikorizah.
Mikoriza je pomembno simbiotsko razmerje, ki se pojavi med glivami in koreninami višjih rastlin. Tako glive kot rastline so deležne ugodnosti tega združenja. Glivične hife prodrejo v zemljo in rastlinam prinesejo hranila, medtem ko rastline glivam nudijo tudi koristi. Zato gre za ekološko pomemben odnos. Najpomembneje je, da lahko glivične hife zrastejo več metrov in v korenine prenašajo vodo in hranila, zlasti dušik, fosfor in kalij. Poleg tega mikorizno združenje ščiti rastlino pred koreninskimi patogeni. Zato se pri rastlinah, ki so v teh simbiotičnih združbah, manj verjetno pojavijo simptomi pomanjkanja hranil. Obstajata dve vrsti mikorize, kot sta ektomikoriza in endomikoriza.
