Ključna razlika med nukleotidom in nukleozidom je v tem, da nukleotid vsebuje fosfatno skupino, medtem ko v nukleozidu manjka fosfatne skupine.
Nukleozidi in nukleotidi so podobna vrsta molekul, ki se razlikujejo po rahli strukturni spremembi. Tako nukleotid kot nukleozid sta sestavljena iz istih dveh komponent; pentozni sladkor in dušikova baza. Poleg tega ima nukleotid eno ali več fosfatnih skupin. Z dodajanjem fosfatne skupine lahko z uporabo encimov, imenovanih kinaza, nukleozid pretvorimo v nukleotid. Nukleotid je gradnik nukleinskih kislin. Po drugi strani pa so nukleozidi dobra protitumorska in protivirusna snov.