Ključna razlika med molsko maso in molekulsko maso je v tem, da molska masa daje povprečno maso molekule, molekularna masa pa maso posamezne molekule.
Atomi se lahko združujejo v različnih kombinacijah in tvorijo molekule in druge spojine. Molekularne strukture dajejo natančna razmerja atomov; tako lahko napišemo molekulske formule za spojine. Te so pomembne pri določanju molekulskih mas ali molskih mas. Molekule lahko označimo z njihovimi masami. Vedeti, da je to zelo koristno pri laboratorijskem delu pri merjenju spojin za reakcije.