Ključna razlika med notranjim in zunanjim dihanjem je, da se notranje dihanje nanaša na nabor presnovnih reakcij, ki se pojavijo v celicah za proizvodnjo energije z oksidacijo glukoze in drugih organskih molekul, medtem ko se zunanje dihanje nanaša na postopek premikanja kisika iz zunanjega okolja. v celice in premikanje ogljikovega dioksida iz telesa v zunanje okolje.
Ko slišite izraz dihanje, vas lahko spomni na postopek, imenovan dihanje. To je postopek vdihavanja in izdihavanja zraka. Razen tega pa obstaja še en postopek dihanja, ki se pojavi znotraj celic organizmov. To je proces, imenovan celično dihanje. Ta dva procesa, dihanje in celično dihanje, imenujemo zunanje in notranje dihanje. Med notranjim in zunanjim dihanjem so razlike v mnogih pogledih. Kljub temu sta notranje in zunanje dihanje medsebojno povezano, saj notranje dihanje uporablja kisik, ki prihaja skozi zunanje dihanje, zunanje dihanje pa odstranjuje ogljikov dioksid; stranski produkt notranjega dihanja.