Ključna razlika med resonančnim in mezomernim učinkom je v tem, da je resonanca rezultat interakcije med osamljenimi elektronskimi pari in veznimi elektronskimi pari, medtem ko je mezomerni učinek posledica prisotnosti substituentnih skupin ali funkcionalnih skupin.
Dva kemična koncepta resonance in mezomernega učinka določata natančno kemijsko strukturo organske molekule. Resonanca nastane v molekulah, ki imajo osamljeni elektronski par na katerem koli od atomov v molekuli. Mezomeren učinek nastane, če ima molekula substituente ali funkcionalne skupine. Oba pojava sta pogosta v organskih molekulah.
