Ključna razlika med atomskim kisikom in molekularnim kisikom je, da je atomski kisik zelo reaktiven in ne obstaja v ozračju, kot je, medtem ko je molekularni kisik manj reaktiven in obstaja v ozračju, kakršen je. Poleg tega je atomski kisik prosti radikal s simbolom O (3P), medtem ko je molekularni kisik dvoatomski kisik s simbolom O 2.
Kisik je kemični element z atomsko številko 8. Ko pa govorimo o kisiku, ki se pogosto uporablja, govorimo o molekularnem kisiku, ki ga dihamo. Ima dva atoma kisika, ki sta medsebojno vezana s kovalentno vezjo. Atomski kisik ima en atom kisika. Zato zaradi visoke reaktivnosti ne more obstajati kot posamezna kemijska vrsta.