Ključna razlika med Harrisovim in Mayerjevim hematoksilinom je, da se Harrisov hematoksilin uporablja pri regresivnem obarvanju, Mayerjev hematoksilin pa pri progresivnem obarvanju.
Hematoksilin je osnovno barvilo, ki se pogosto uporablja v histopatologiji. Je naravno barvilo, pridobljeno iz drevesa Haematoxylon campechianum. Je temno modra ali vijolična barva. Hematoksilin omogoča prikaz mikroskopskih jedrskih podrobnosti celičnih in tkivnih komponent. To barvilo je pozitivno nabito, zato se veže z negativno nabitimi snovmi, kot sta DNA in RNA, in jih obarva v vijolično barvo. Za hematoksilin je potrebna žila, ki pomaga pri povezovanju s tkivnimi komponentami. Mordant je kemikalija, zlasti sol aluminija, železa, volframa, ki olajša vezavo barvila na tkivno komponento.
Glede na žleze, ki jih vsebujejo, je na voljo več vrst hematoksilinov. Nekateri med njimi so Ehrlichovi, Mayerjevi, Harrisovi, Gillovi, Delafieldovi, Coleovi in Carazzijevi hematoksilini. Tako Harrisova kot Mayerjeva formulacija hemoksilina sta žvečilni hematoksilini na osnovi aluminija.